由上至下：1. 图谱镜像比对；2.图谱相减；3. 图谱一阶导数；4. 图谱二阶导数
图谱运算提供对一个或一对样品图谱进行运算处理或精确比较的功能。该功能可由 图谱数据处理图谱运算，或 分析菜单图谱运算进行访问。更精确的针对色谱峰匹配情况进行的比对功能详见3.7.3图谱色谱峰匹配结果分析。
叠加图谱窗口具有和样品图谱窗口类似的鼠标和快捷键操作。此外可通过设定属性栏中的Y轴平移选项或对应的工具栏按钮□13，从而对镜像图谱间距进行精确调节。
如果在比较中选择了一个无效样品（如无效的共有模式），则会提示相应的错误信息。
该视图对应的属性设置栏选项内容如下表所示：
| 项目名称 | 说明 | 选项 |
|---|---|---|
| 图谱运算 | 提供两张图谱间差异信息的运算比对功能，以及图谱的求导功能。 | |
| 运算逻辑 | 选择显示或处理待比较图谱的运算逻辑。
当两个待比较样品的响应值相差较大时，为了便于观察可选择镜像（数据标准化）模式 |
镜像、镜像（数据标准化）、相减、相加、1阶导数、2阶导数 |
| 上方图谱 | 选择比较时位于上方的样品图谱 | 当前样品列表 |
| 下方图谱 | 选择比较时位于下方的样品图谱 | 当前样品列表 |
| Y轴平移 (%) | 设置叠加图中每个图谱在Y轴的偏移量 | 取值范围：-50～50 |
其中的部分图谱运算功能示例如下：