与一维色谱法相比，二维色谱法在峰容量等方面性能显著提高。通过不同于传统HPLC的阀切换系统，即可在一维色谱的基础上实现二维分离、分析的功能。ChemPattern支持处理和显示二维色谱数据（图3-21）。此外该功能也可用于不同色谱条件或不同来源样品等的数据同步比较分析。
该功能可由 图谱数据处理二维色谱，或 分析菜单二维色谱进行访问，其属性列表具有以下设置内容：
| 项目名称 | 说明 | 选项 |
|---|---|---|
| 二维图谱 | 生成二维色谱指纹图谱，对所有馏分的二次分离图谱进行综合显示 | |
| 二维图谱来源 | 选择二维图谱的来源，二维分离的图谱需要在文件夹中按顺序存放 | |
| 数据预处理 | 选择分析前对数据进行预处理的方法 | 无、自动缩放 |
| 色谱峰显示 | 设置二维图谱的色谱峰显示方法 | 线性、等高线 |
| 可视化 | 设置图谱的各类可视化参数 | |
| 图谱显示方式 | 选择以平面还是立体方式显示二维色谱图 | 2D、3D |
| 显示一维色谱图 | 是否在二维图谱外侧同步显示一维色谱图 | |
| 一维图谱 | 选择在二维图谱右侧垂直显示的一维分离图谱 | |
| 图形背景色 | 选择图表的背景色 | |
| 渐变色 | 设置图谱的渐变颜色 | |
| 3D渲染选项 | 设置3D视图中图形的渲染参数 | > |
| X轴旋转角度 | 视图的X轴旋转角度，-180°～180°可选 | 取值范围：-180～180 |
| Y轴旋转角度 | 视图的Y轴旋转角度，-180°～180°可选 | 取值范围：-180～180 |
| X轴偏移 | 设置视图的X轴偏移程度，像素为单位 | |
| Y轴偏移 | 设置视图的Y轴偏移程度，像素为单位 | |
| 视图缩放 | 3D物体的缩放倍数，0.1～3倍可选 | 取值范围：0.1～3 |
| 挤压系数 | 设置3D物体的立体化程度。0（平面）～1可选 | 取值范围：0～1 |
下方列表栏的表头依次为“显示”选择框、样品编号、样品名称、时程、峰数目，以及样品备注信息。
如果开启显示一维图谱，则单击列表项将在二维图谱中动态显示选定的图谱；
单击“显示”选择框可动态设置该样品图谱在二维图谱中显示与否。
如选择数据预处理的自动缩放选项，将使得每个一维分离的图谱以相同的响应值进行显示，如图3-22所示。
