色谱峰保留时间的漂移现象属于色谱实验系统误差和不确定性的一部分，只能在一定程度上得以减弱而无法完全消除。在对复杂体系分析所获得的色谱指纹图谱中，通常待测组分数量达到数十甚至数百的规模，此外较传统含量测定而言进一步增加的色谱峰共洗脱现象使得保留时间漂移的情况更加复杂。如果不施以纠正措施，则任何微小的保留时间漂移都会导致样品间色谱峰的匹配错位，使得分析结果严重偏离。
因此确立不同样品图谱间色谱峰正确的对应关系，是顺利进行色谱指纹图谱分析以及化学计量学计算的重要先决条件。学术界对于色谱峰的保留行为，以及如何从仪器和算法角度进行校正（Peak Alignment）开展了大量深入研究，ChemPattern据此实现了以自动校正方式为主、手动校正方式为辅的复杂体系色谱峰保留时间综合校正模式，为上述关键环节提供了简便易行、稳健可靠的解决方案。
整个匹配过程以软件自动模式匹配为核心，支持分段渐进校正模式，并辅以利用各类分析化学相关数据（内外标、光谱、质谱数据等），以及结合背景知识与经验判断等综合手段的人工校正，从而在最大程度上克服了色谱指纹图谱数据在化合物种类、样品性质和色谱条件等方面所体现的灰箱状态和不确定性。
该校正基准的可参比性和灵活性还体现在其基于特定的色谱保留时间而非囿于图谱中具体的共有峰的存在与否，因此不受样品图谱中色谱峰和共有峰发生是否变化的影响，还可以将所添加的任何保留时间位置为基准进行特殊情况下的峰校正。