上图：规则背景漂移扣除；下图：不规则背景扣除
中值基线滤波（median baseline filtering，MBF），又称中值滤波，是一种常用的非线性数字平滑滤波。当作用于色谱轮廓曲线时，可过滤掉变化较缓和的低频基线噪音部分，而保留变化较剧烈的高频色谱峰信号部分。因而对于各类规则或不规则的基线漂移情况均具有较好的滤除效果。
中值滤波本质是一种基于统计排序理论的平滑去噪技术，原理较为直观，同时基线扣除效果稳定可靠。ChemPattern实现的中值滤波采用可变尺寸的滑动窗口设计，确保在保护信号区域的同时对于各类图谱数据均具有较好的背景扣除效果（图12-1）。