5.7 质谱缓存
质谱检测器所记录的总离子流色谱图,特别是液质联用中的高分辨质谱检测器所产生的单个复杂样品文件的大小可达百兆甚至吉字节(GB)规模。而对于复杂体系的化学计量学与指纹图谱分析则要求同时对大量样本进行高通量解析,使得即便计算机工作站的处理器性能和内存容量也显得捉襟见肘,因此需要采用质谱数据缓存的方式来节约硬盘存储空间并提高数据的处理速度。
质谱数据硬盘缓存
- 在ChemPattern中,质谱硬盘数据缓存以Cache文件扩展名类型存储于解决方案的子目录中,以节约解决方案的硬盘存储空间。方法是在初次导入样品数据后,通过质谱去背景命令对缓存文件进行压缩。详见5.4质谱去背景。
- 若Cache文件被误删,则ChemPattern会自动尝试从导入样品时使用的源文件中重建缓存,若源文件也无法访问,则会给出详细的错误提示信息。
- 要复制质谱解决方案文件,必须同时拷贝缓存子目录。使用“解决方案另存为”命令可达到同样的目的。
质谱数据内存缓存
- 在ChemPattern中,还可启用质谱数据缓存来加速样品的质谱数据分析和处理。但该方法在样品较多时容易造成计算机内存不足,应根据实际情况权衡使用。详见2.13 缓存管理。
- 质谱解决方案在执行一些数据预处理算法过程中需要消耗大量内存,譬如质谱去背景和解卷积操作等。此时更容易与质谱数据内存缓存功能发生内存抢占问题。
对于高度冗余的色质联用数据而言,对于复杂体系化学计量学分析中最重要的各个化合物的准分子离子峰信息只占全部数据量的极小部分。不同质谱信息表征类型的数据规模的大小关系可大致表示为:高分辨质谱轮廓图(GB)≫高分辨质谱棒状图>背景扣除后的质谱图≫解卷积质谱图(MB)。
因此质谱的化学计量学解析过程也是将海量信息化繁为简的有效途径。