11.3.1 系统聚类分析

系统聚类分析视图提供一维（或称单向）凝聚方式的系统聚类分析（图11-5上），以及更复杂的二维（双向）系统聚类分析（图11-5下）。有关系统聚类分析的方法原理详见12.18系统聚类分析。

在属性栏中有关系统聚类分析的选项及其说明见下表：

一维聚类分析

聚类分析的结果可受到不同的距离计算、连接方法以及数据预处理方法的影响（图11-6），因此在获得最理想的聚类结果之前有必要对参数进行优化调整。

谱系聚类图的可视化内容可进行以下设置：

• 归属于不同分组的样品簇以该分组的默认颜色予以显示，无分组的样品簇以灰色线条显示；
• 树型线条的宽度可根据2.11软件可视化设置中的标记线宽度设定进行显示；
• 可通过工具栏的设置文本高度下拉按钮，对谱系图下方显示的样品名称文本高度进行调节。

中药材白芍、赤芍及川赤芍（Paeonia lactiflora, Paeonia veitchii）的色谱指纹图谱聚类分析结果。左上图：连接方法：近邻法；右上图：连接方法：远邻法；左下图：连接方法：未加权重心法；右下图：连接方法：离差平方和法。

二维聚类分析

二维系统聚类分析（亦称双向聚类）是在一维聚类分析的基础上增加了对自变量进行同时聚类的功能，并同步显示二者聚类结果的色彩图。通过色彩图和两侧的谱系聚类图，可直观地观察每个样品中的共有峰在样本和自变量两个维度中所形成的聚类模式，以及其对聚类结果的影响。

上图：数据预处理：标准化（观测）；距离计算：欧氏距离；连接方法：近邻法；树高度：20%；文本高度：20%；
中图：数据预处理：平方根变换；距离计算：街区距离；连接方法：加权重心法；树高度：40%；文本高度：5%；
下图：数据预处理：平方根变换；距离计算：街区距离；连接方法：未加权重心法；树高度：30%；文本高度：20%；聚类顺序：自变量优先；

调整树形结构

在一维或二维系统聚类图的任意树形节点（水平分支的中点）上单击鼠标右键，该节点将以高亮显示。此时在弹出的快捷菜单中选择“交换左右树”，即可对指定节点的左右两侧树形结构进行翻转对调，如图11-8所示。